Seit 1993 führt die ABU systematische Untersuchungen in der Lippe und der Lippeaue durch, die die Wirkungen der Renaturierungsmaßnahmen des Landes NRW dokumentieren und bewerten. Schwerpunkte sind die Entwicklung der Fischfauna im Fluss und in der Aue, der Makrophythen im Fluss und der Vegetationsstruktur der Aue unter dem Einfluss von Hochwassern und ganzjährig weidenden Rindern und Pferden.